У Nature представили модель противірусної Т-клітинної відповіді в органоїдах легень
У науковій роботі описано моделювання противірусних Т-клітинних відповідей у людських органоїдах легень і оприлюднено набори даних.
У журналі Nature 7 жовтня опублікували дослідження про моделювання відповідей тканинних резидентних противірусних Т-клітин у людських органоїдах легень. Робота має назву «Human lung organoid modelling of tissue-resident antiviral T cell responses» і присвячена дослідженню локальної імунної відповіді в тканинах дихальної системи.
Дані дослідження
Автори повідомили, що набори даних одноклітинного РНК-секвенування розміщені в базі Gene Expression Omnibus під кодами GSE216049 і GSE344986. До них увійшли необроблені та оброблені дані, а також фінальні об’єкти Seurat з анотаціями. Дані bulk RNA-seq депоновано в цій самій базі під кодом GSE230398.
Учасники роботи
Першими авторами з рівним внеском зазначені Joseph K. Rathkey і Shannon S. Choi. Серед установ, представлених у дослідженні, — Медична школа Стенфордського університету, Університет Каліфорнії в Сан-Франциско, Університет Північної Кароліни в Чапел-Гілл, La Jolla Institute for Immunology та Arc Institute.
У переліку використаної літератури наведено роботи про тканинні резидентні Т-клітини в дихальних шляхах, локалізовану імунну пам’ять після інфекції SARS-CoV-2, а також органоїдні моделі легень. У подяках автори згадали Stanford Tissue Bank, Donor Network West, лабораторні й імунологічні центри Стенфорда. Ізолят SARS-CoV-2 USA-WA1/2020 для роботи отримали через BEI Resources Національного інституту алергії та інфекційних хвороб США.
