У Nature описали модуль цвітіння для двосезонного вирощування культур
У Nature представили дослідження модуля регуляції цвітіння, пов’язаного з двосезонним вирощуванням культур і генетикою ячменю.
Дослідники представили роботу про консервативний модуль регуляції часу цвітіння, який лежить в основі двосезонного вирощування сільськогосподарських культур. Дослідження зосереджене на ячмені та охоплює геномні дані, польові випробування й фенотипування рослин.
Геномні дані ячменю
Як повідомляє Nature, автори згенерували дані секвенування для 510 зразків ячменю. Додатково вони використали послідовності ще 22 зразків із бази даних Національного центру біотехнологічної інформації США. Усі індивідуальні зразки наведено в додатковій таблиці дослідження, а нові дані передали до China National Center for Bioinformation у межах BioProject PRJCA049684.
Аналіз генів і польові досліди
У роботі аналізували генетичне різноманіття генів PhyC і VRN-H1, пов’язаних із регуляцією цвітіння у ячменю. Команда також проводила польові випробування та оцінювала фенотипи рослин. Окремим напрямом стали створення майже ізогенних ліній, редагування аденінових основ геному та моделювання структури білків.
Автори вказали, що використані для дослідження shell- і Perl-скрипти доступні у відкритих репозиторіях. У статті також зазначено, що подано патентну заявку.
