Nature відкликав статтю 2014 року про зсув рамки зчитування в CCR5
Nature відкликав статтю 2014 року про зсув рамки зчитування в CCR5 через артефакт сплайсингу у репортерному тесті.
Редактори журналу Nature відкликали статтю 2014 року, присвячену програмованому зсуву рамки зчитування рибосом у матричній РНК гена CCR5. Рішення ухвалили через втрату довіри до даних, які підтримували один із ключових висновків дослідження. Про це повідомляє Nature.
У відкликаній роботі автори досліджували ймовірну послідовність CCR5, здатну спричиняти зсув рамки зчитування на −1. Цю послідовність клонували у вектор подвійного люциферазного репортера p2luci, де транскрипція відбувалася під контролем промотора SV40 і посилювалася штучним інтронoм.
Артефакт під час сплайсингу
Подальша перевірка встановила, що похідна від CCR5 послідовність містила прихований акцепторний сайт сплайсингу на 3′-кінці. Це призводило до утворення артефактних варіантів сплайсингу.
Автори також намагалися відтворити результати за допомогою вдосконаленої версії репортерної системи подвійної люциферази. У ній промотор SV40 замінили сильним промотором CMV, а штучний інтрон прибрали. За таких умов послідовність CCR5 не спричиняла рівнів програмованого зсуву рамки зчитування на −1, які можна було б виявити.
Позиції авторів
Як зазначили редактори, щонайменше дві інші наукові групи відтворили ці висновки. Це свідчить, що раніше зафіксована активність зсуву рамки зчитування могла бути наслідком артефакту сплайсингу, а не властивістю послідовності CCR5.
Ashton Trey Belew, Sharmishtha Musalgaonkar, Vivek M. Advani та Sergey O. Sulima погодилися з відкликанням. Arturas Meskauskas, Wojciech K. Kasprzak, Bruce A. Shapiro та Jonathan D. Dinman виступили проти цього рішення.
